<var id="tpjlz"><dl id="tpjlz"></dl></var>
<menuitem id="tpjlz"></menuitem><cite id="tpjlz"><video id="tpjlz"><thead id="tpjlz"></thead></video></cite>
<var id="tpjlz"><video id="tpjlz"></video></var><cite id="tpjlz"><video id="tpjlz"><menuitem id="tpjlz"></menuitem></video></cite><var id="tpjlz"></var>
<var id="tpjlz"><span id="tpjlz"></span></var>
<var id="tpjlz"><strike id="tpjlz"></strike></var>
<cite id="tpjlz"></cite>

歡迎來到 阿儀網

免費注冊

首頁 | 產品 | 求購 | 資訊 | 專題 | 找廠商 | 打聽 | 人才 | 品牌 | 資料 | 技術文獻 | 展會 | 耗材 | 配件 | 新品 | 促銷 | 書籍 | 招標 | 優質儀器
廣告
廣告

您的位置:首頁>公司動態>上海谷研實業有限公司>基因組單細胞解析新型算法

基因組單細胞解析新型算法

2020/9/8 14:39:08提供者: 上海谷研實業有限公司 進入該公司展臺
已有472人關注

       近期,中國科學院上海營養與健康研究所Andrew Teschendorff研究員指導的研究團隊開發了一種名為“EPISCORE”的新型算法,用以從單細胞RNA-Seq中分析獲得給定組織類型中的各種細胞類型,并從中發現蘊含與疾病發生相關DNA甲基化變化的特定細胞類型。EPISCORE算法利用了組織特異性單細胞RNA-Seq圖譜數據的強大功能和高分辨率特性,基于細胞類型特異性標記物的DNA甲基化差異特性,有效地將組織特異性mRNA表達圖譜轉化為單細胞分辨率的組織特異性DNA甲基化圖譜。利用EPISCORE算法對肺癌數據開展研究,成功揭示了肺癌內皮細胞中的DNA甲基化表觀遺傳改變,提示表皮細胞向間充質細胞的轉化過程是癌細胞入侵和轉移的基礎。
   
      DNA甲基化是發生在DNA上的共價修飾,作為一種重要的表觀遺傳類型,DNA甲基化受多種疾病及風險因子的影響,與疾病的發生和發展有潛在的因果關系,并有望作為疾病診斷的一種新型生物分子標記物。但是,由于實驗成本和條件的限制,大量的DNA甲基檢測一般只在混合了多種細胞類型的復雜組織中進行,得到的是多個不同細胞類型DNA甲基化變化的平均值,難以用來統計不同細胞類型中DNA甲基化的功效及其生物學解釋。因此,領域內迫切需要開發一種高效的計算生物學研究方法,能夠在單細胞層面解析復雜組織中的差異DNA甲基化組。

    由于大多數公開的DNA甲基化數據源自于混合了多種細胞類型的復雜組織樣本,因此無法發揮其作為疾病診斷分子標志物的潛力。EPISCORE的開發則使得科研人員能夠重新分析這些公開發表的表觀遺傳數據集,在精確獲得復雜組織樣本中不同細胞類型比例的基礎上,進一步在單細胞水平鑒定細胞特異性的DNA甲基化變化,對闡明表觀遺傳變化在疾病發生和發展中的因果作用具有重要意義。此外,EPISCORE算法低成本的特點使它成為單細胞甲基化組學分析的有效替代方法。而且,區別于單細胞甲基化組學分析,EPISCORE算法可應用于任意組織類型的EWAS(表觀基因組關聯分析)研究。
 
  
 

微信號:ayiwangapp17

標簽:細胞  

投稿箱

如果您儀器行業、企業相關新聞稿件發表,或進行資訊合作,歡迎聯系本網編輯部, 郵箱:1256925161@qq.com

為您推薦

廣告

圖片視點

上海光源實現儲存環單束團流強高于20mA和同步輻射單脈沖超快硬X

優質產品

版權聲明

凡本網注明"來源:阿儀網"的所有作品,版權均屬于阿儀網,未經本網授權不得轉載、摘編或利 用其它方式使用。已獲本網授 權的作品,應在授權范圍內使用,并注明"來源:阿儀網"。違者本網將追究相關法律責任。

本信息由注冊會員:上海谷研實業有限公司發布并且負責版權等法律責任。

旗下頻道

色譜儀 光譜儀 反應釜 試驗箱 試驗機 攪拌器 培養箱 離心機 水分測定 氣體檢測 量熱儀 石油儀器 純水器 比表面儀 溫度記錄 流量計 萬用表 顯微鏡 粒度儀 測厚儀 硬度計 酸度計 元素分析 生物試劑 電線電纜 天平衡器 傳感器 食品檢測 壓力儀表 電化學 測厚儀 閥門儀表 電力儀表 干燥設備 藥物檢測